Difference between revisions of "Eubacteria"

From biota
Jump to navigationJump to search
 
(12 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
Виды прокариотных организмов (кроме цианобактерий) приведены по системе, принятой в:  
+
[[rus:Eubacteria]]
 +
Species of prokaryotic organisms (except cyanobacteria) are given according to the system given in:  
  
 
1) Bergey’s Manual of Systematic bacteriology // D. R. Boone, R. W. Castenholz (eds) v.1; Springer-Verlag. 2nd ed. 2001;  
 
1) Bergey’s Manual of Systematic bacteriology // D. R. Boone, R. W. Castenholz (eds) v.1; Springer-Verlag. 2nd ed. 2001;  
Line 5: Line 6:
 
2) Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology // D. J. Brenner, N. R. Krieg, J.T. Staley (eds) v.2. part A; Springer-Verlag. 2nd ed. 2005.
 
2) Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology // D. J. Brenner, N. R. Krieg, J.T. Staley (eds) v.2. part A; Springer-Verlag. 2nd ed. 2005.
  
−
[[Горленко|В. М. Горленко]], [[Дубинина|Г. А. Дубинина]], [[Захарчук|Л. М. Захарчук]], [[Татаринова|Н. Ю. Татаринова]]  
+
[[Горленко|В. М. Горленко]], [[Дубинина|Г. А. Дубинина]], [[Захарчук|Л. М. Захарчук]], [[Татаринова|Н. Ю. Татаринова]]
  
−
Бактерии выделены из образцов почвы полуострова Киндо, опресненных участков Великой Салмы, альго-бактериальных матов супралиторали на участках морского побережья, подверженных распреснению от материкового стока, а в высокие приливы - осолонению.
+
Bacteria were extracted from soil samples of the Kindo Peninsula, the freshened areas of the Great Salma, and from algo-bacterial mats of supralittoral sea coast areas, exposed to freshening by continental runoff and to salinity at high tides.
  
 +
=Phylum Proteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005=
 +
==Class Alfaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005==
  
−
=Филум (отдел) Proteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005=
+
*[[Order Rhodospirillales Pfennig&Trüper 1984]]
−
==Класс Alfaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005==
 
  
−
*[[Порядок Rhodospirillales Pfennig&Trüper 1984]]
+
*[[Order Rhizobiales Kuykendall 2005]]
  
−
*[[Порядок Rhizobiales Kuykendall 2005]]
+
*[[Order Caulobacterales Henrici & Johnson 1935]]
  
−
*[[Порядок Caulobacterales Henrici & Johnson 1935]]
+
==Class Betaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005==
 +
*[[Order Burkholderiales Garrity, Bell & Lilburn 2005]]
  
−
==Класс Betaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005==
+
*[[Order Nitrosomonadales Garrity, Bell & Lilburn 2005]]
−
*[[Порядок Burkholderiales Garrity, Bell & Lilburn 2005]]
 
  
−
*[[Порядок Nitrosomonadales Garrity, Bell & Lilburn 2005]]
+
==Class Gammaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005==
  
−
==Класс Gammaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005==
+
*[[Order Chromatiales Imhoff 1984]]
  
−
*[[Порядок Chromatiales Imhoff 1984]]
+
*[[Order Pseudomonadales Orla-Jensen 1921]]
  
−
*[[Порядок Pseudomonadales Orla-Jensen 1921]]
+
*[[Order Alteromonadales Bowman & McMeekin 2005]]
  
−
*[[Порядок Alteromonadales Bowman & McMeekin 2005]]
+
*[[Order Vibrionales Veron 1965]]
  
−
*[[Порядок Vibrionales Veron 1965]]
+
*[[Order Enterobacteriales Rahn 1937]]
  
−
*[[Порядок Enterobacteriales Rahn 1937]]
+
*[[Order Thiotrichales Garrity, Bell & Lilburn 2005]]
  
−
*[[Порядок Thiotrichales Garrity, Bell & Lilburn 2005]]
+
=Phylum Chlorobi Garrity & Holt 2001=
 +
==Class Chlorobia Garrity & Holt 2001==
  
−
=Филум (отдел) Chlorobi Garrity & Holt 2001=
+
*[[Order Chlorobiales Trüper 1984]]
−
==Класс Chlorobia Garrity & Holt 2001==
 
  
−
*[[Порядок Chlorobiales Trüper 1984]]
+
=Phylum Chloroflexi Imhoff 2001=
 +
==Class Chloroflexi Imhoff 2001==
  
−
=Филум (отдел) Chloroflexi Imhoff 2001=
+
*[[Order Chloroflexales Trüper 1984]]
−
==Класс Chloroflexi Imhoff 2001==
 
  
−
*[[Порядок Chloroflexales Trüper 1984]]
+
=Phylum Firmicutes Garrity & Holt 2001=
 +
==Class Bacilli  Ludwig & Klenk 2001==
  
−
=Филум (отдел) Firmicutes Garrity & Holt 2001=
+
*[[Order Bacillales Ludwig & Klenk 2001]]
−
==Класс Bacilli  Ludwig & Klenk 2001==
 
  
−
*[[Порядок Bacillales Ludwig & Klenk 2001]]
+
=Phylum Actinobacteria Brown et al. 2005=
 +
==Class Actinobacteria Stackebrandt et al.1997==
  
−
=Филум (отдел) Actinobacteria Brown et al. 2005=
+
*[[Order Actinomycetales Buchanan 1917]]
−
==Класс Actinobacteria Stackebrandt et al.1997==
 
  
−
*[[Порядок Actinomycetales Buchanan 1917]]
+
=Phylum Bacteroidetes Garrity & Holt 2001=
 +
==Class Flavobacteria Garrity & Holt 2001==
  
−
=Филум (отдел) Bacteroidetes Garrity & Holt 2001=
+
*[[Order Flavobacteriales Garrity & Holt 2001]]
−
==Класс Flavobacteria Garrity & Holt 2001==
 
  
−
*[[Порядок Flavobacteriales Garrity & Holt 2001]]
 
  
 +
'''CYANOBACTERIA (PROKARYOTIC ALGAE)'''
  
−
'''ЦИАНОБАКТЕРИИ (ПРОКАРИОТНЫЕ ВОДОРОСЛИ)'''
+
Authors: Е.А. Кузнецов, К.Л. Тарасов
  
−
Авторы: Е.А. Кузнецов, К.Л. Тарасов
+
Phylum Cyanophyta (Cyanobacteria), blue-green algae
  
−
Отдел Cyanophyta (Cyanobacteria), сине-зелёные водоросли
+
==Class Cyanophyceae==
−
==Класс Cyanophyceae==
 
  
−
*[[Порядок Chroococcales]]
+
*[[Order Chroococcales]]
  
−
*[[Порядок Nostocales]]
+
*[[Order Nostocales]]
−
===Семейство Hapalosiphonaceae A. A. Elenkin===
 
−
Род Hapalosiphon Nägeli ex Bornet & Flahault
 
−
*Hapalosiphon fontinalis (C. Agardh) Bornet – наземн.; на мхах; ед. (Давыдов, 2006).
 
  
−
===Семейство Microchaetaceae Lemmermann===
+
*[[Order Oscillatoriales]]
−
Род Tolypothrix Kützing ex Bornet & Flahault 1886
 
−
*Tolypothrix distorta (Fl. Dan.) Kützing – бент.; ручьи; об. (собств.).
 
−
*Tolypothrix saviczii Kossinskaya - на влажных наземных скалах, об., о. Кастьян; р., Черные Щельи.
 
−
*Tolypothrix tenuis Kützing – бент.; устья ручьев; об. (собств.).
 
  
−
===Семейство Nostocaсеае Eichler===
+
*[[Order Pseudanabaenales]]
−
Род Anabaena Bory de Saint-Vincent ex Bornet & Flahault
 
−
*Anabaena circinalis Rabenhorst (=Anabaena hassallii (Kützing) Wittrock) – пресн., оз. Верх., Водопров.; планкт. (Бизина, 1998). Планкт.; оз. Верхнее, Ершевские; об. (собств.).
 
−
*Anabaena flosaquae (Lyngbye) Brébisson – планкт.; оз. Полупресное; об.; на опресн. уч-ках В. Салмы; ред. (собств.).
 
−
*Anabaena lemmermannii P. Richter – на пыльце сосны; г. Кислая, Ругоз., В. Салма; об. (собств.).
 
−
*Anabaena pseudoscillatoria Bory de Saint-Vincent – эпифит на Zostera; г. Кислая; pед. (собств.: Anabaena oscillarioides Bory).
 
−
*Anabaena spiroides Klebs – планкт.; оз. Полупресное, Ершовские; ред. (собств.).
 
−
Род Aphanizomenon A. Morren ex Bornet & Flahault
 
−
*Aphanizomenon flos-aquae (Linnaeus) Ralfs ex Bornet & Flahault – планкт., ед., слв. оз. Полусолёное
 
−
Род Nodularia Mertens ex Bornet & Flahault
 
−
*Nodularia harveyana (Thwaites) Thuret – обраст.; камни в устьях ручьев; об. (собств.).
 
−
*Nodularia spumigena Mertens – наземн.; на отмер. мхах; ед. (Давыдов, 2006). Планкт.; опресн. уч-ки В. Салмы; ред.; обраст.; солон., пресн.; об. (собств.).
 
−
Род Nostoc Vaucher ex Bornet & Flahault
 
−
*Nostoc punctiforme (Kützing) Hariot – наземн.; на мхах; ед. (Давыдов, 2006).
 
  
−
===Семейство Rivulariaceae Frank===
+
*[[Order Synechococcales]]
−
Род Calothrix C.Agardh ex É. Bornet & C. Flahault
 
−
*Calothrix crustacea Thuret ex Bornet & Flahault – обраст.; на Fucus serratus в В. Салме; ед.; на скалах субл.; об. (собств.).
 
−
*Calothrix fasciculata C. Agardh – наземн., супр.; на камнях, на лишайн.; ед. (Давыдов, 2006).
 
−
*Calothrix gracilis F. E. Fritsch – наземн.; на мокром камне; ед. (Давыдов, 2006).
 
−
*Calothrix parietina (Nägeli) Thuret f. nodosa Erceg. – наземн., супр., лит; на отмер. мхах, на камнях; ед. (Давыдов, 2006).
 
−
*Calothrix ramenskii Elenkin – на затопленой древ.; оз. Водопров.; ед. (собств.).
 
−
*Calothrix scopulorum (Weber & Mohr) C. Agardh – супр.; в щелях скал; ред. (Возжинская, 1967).
 
−
*Calothrix vivipara Harvey – на скалах супр.; б. Биофильтров; ед. (собств.).
 
−
Род Rivularia (Roth) C.Agardh ex Bornet & Flahault
 
−
*Rivularia atra Roth – эпифит на Fucus; об. (собств.).
 
−
*Rivularia bullata (Poir.) Berkeley – обраст.; камни в р-не мидиевой банки у о. Б. Ерем.; ед. (собств.).
 
−
*Rivularia coadunata (Sommerf.) Foslie – обраст.; прибрежные скалы, пос. ББС; ед. (собств.).
 
−
 
 
−
===Семейство Scytonemataceae Frank===
 
−
Род Scytonema C.Agardh ex Bornet & Flahault
 
−
*Scytonema alatum (Berkeley) Borzi – обраст.; стенки лит. ванны; о. Касьян; ед. (собств.).
 
−
*Scytonema mirabile Bornet – планкт.; оз. Верх.; ред. (собств.).
 
−
 
 
−
===Семейство Stigonemataceae (Bornet & Flahault) Borzi===
 
−
Род Stigonema C.Agardh ex Bornet & Flahault
 
−
*Stigonema minutum (C. Agardh) Hassall – наземн., супр.; на мокром камне, скалах, мхах; част. (Давыдов, 2006). Бентос; супралиторальные ванны; м. Киндо, о. Касьян; ред. (собств.)
 
−
*Stigonema ocellatum Thuret – обраст.; стенки супр. ванн; об.; на мхах; болота; ред. (собств.).
 
−
 
 
−
*[[Порядок Oscillatoriales]]
 
−
===Семейство Ammatoideaceae===
 
−
Род Homoeothrix (Thuret ex Bornet & Flahault) Kirchner
 
−
*Homoeothrix endophytica Lemmermann – в слизи Batrachospermum; оз. Верх.; ед. (собств.).
 
−
 
 
−
===Семейство Oscillatoriaсеае Engler===
 
−
Род Lyngbya C. Agardh ex Gomont
 
−
*Lyngbya confervoides C. A. Agardh ex Gomont – обраст.; на прибрежных скалах; м. Киндо, б. Биофильтров, о. Кастьян; ред. (собств.).
 
−
*Lyngbya majuscula (Dillwyn) Harvey ex Gomont – обраст.; на сваях пирса ББС; об. (собств.).
 
−
*Lyngbya semiplena (C. Agardh) J. Agardh ex Gomont – мор., лит.; на ил-песч. грунт.; ед. (Блинова, 1962). Супр.; на камнях, на зел. вод. (Давыдов, 2006).
 
−
*Lyngbya splendens Tschern. – планкт.; оз. Верхнее; об. (собств.).
 
−
Род Oscillatoria Vaucher ex Gomont
 
−
*Oscillatoria bonnemaisonii (P. L. Crouan & H. M. Crouan) P. L. Crouan & H. M. Crouan ex Gomont – обраст.; камни на верхней лит.; об.; планкт.; В. Салма; ред. (собств.: Oscillatoria bonnemaisonii (Crouan) Gomont).
 
−
*Oscillatoria sancta Kützing ex Gomont – планкт.; оз. Ершевские; ред; обрастания; солон., пресн.; об. (собств.).
 
−
 
 
−
===Семейство Phormidiасеае===
 
−
Род Leibleinia (Gomont) L. Hoffman
 
−
*Leibleinia willei (Setchell & Gardner) P. C. Silva – эпифит на Enteromorpha, лит. о. М. Еремеевский; ед. (собств.: Lyngbya nordgaardii Wille).
 
−
Род Microcoleus Desmazières ex Gomont
 
−
*Microcoleus hospitus Hansgirg - в скоплениях (клубках) нитч. бурых водор., ед., лит. лужа, о. М. Ерем.
 
−
Род Phormidium Kützing ex Gomont
 
−
*Phormidium chlorinum (Kützing ex Gomont) Umezaki & Watanabe – бентос; супралиторальные ванны; м. Киндо, о. Костьян; ред. (собств.: Oscillatoria chlorina (Kützing) Gomont.).
 
−
*Phormidium laetevirens (P.L. Crouan & H.M. Crouan ex Gomont) Anagnostidis & Komárek – обрастания; камни в р-не мидиевой банки у о. Б. Еремеевского; ед. (собств.: Oscillatoria laetevirens Crouan).
 
−
*Phormidium limosum (Dillwyn) P.C. Silva – пресн., оз. Верх., Водопров.; планкт. (Бизина, 1998: как Oscillatoria limosa (Dillwyn) C. Agardh). Планкт.; солон., пресн.; об. (собств.: Oscillatoria tenuis C.A.Agardh).
 
−
Род Symplocastrum (Gomont) Kirchner ex Engler & Prantl
 
−
*Symplocastrum friesii (Gomont ex Gomont) Kirchner – бент.; берега ручья напротив о. Б. Еремеевского; ед. (собств.: Schizothrix friesii (C.A.Agardh) Gomont).
 
−
 
 
−
===Семейство Schizotrichaceae Elenkin===
 
−
Род Schizothrix Kützing ex Gomont
 
−
*Schizothrix coriacea (Kützing) Gomont – на древес.; супр.; б. Биофильтров; ед. (собств.).
 
−
*Schizothrix heufleri Grunow – на влажных камнях; Ч. Щельи; ед. (собств.).
 
−
 
 
−
*[[Порядок Pseudanabaenales]]
 
−
===Семейство Pseudanabaenaсеае===
 
−
Род Jaaginema Anagnostidis & Komárek
 
−
*Jaaginema angustissimum (W. West & G. S. West) Anagnostidis & Komárek – в ил. грунте лит.; территория пос. ББС; об. (собств.: Oscillatoria angustissima W. & G.S.West).
 
−
Род Leptolyngbya Anagostidis & Komárek
 
−
*Leptolyngbya valderiana (Gomont) Anagostidis & Komárek – наземн.; на отмер. мхах; ед. (Давыдов, 2006).
 
−
Род Limnothrix Meffert
 
−
*Limnothrix planctonica (Woloszynska) Meffert – планктон; оз. Верхнее; об. (собств.: Oscillatoria planctonica Woloszynska).
 
−
Род Planktolyngbya Anagnostidis & Komárek
 
−
*Planktolyngbya bipunctata (Lemmermann) Anagnostidis & Komárek – обраст.; на камнях, скалах; пресн.; об. (собств.: Lyngbya bipunctata Lemmermann).
 
−
*Planktolyngbya lacustris (Lemmermann) Anagnostidis & Komárek – планкт.; оз. В. Ерш.; ед. (собств. Lyngbya lacustris Lemmermann).
 
−
*Planktolyngbya limnetica (Lemmermann) J. Komárková-Legnerová & G. Cronberg – планкт.; г. Нильма, оз. Н. Ерш.; ред. (собств.: Lyngbya limnetica Lemmermann).
 
−
Род Pseudanabaena Lauterborn
 
−
*Pseudanabaena frigida (F.E. Fritsch) Anagnostidis – планкт.; озёра; ред. (собств.: Phormidium frigidum F.Fritsch.).
 
−
*Pseudanabaena persicina (Reinke ex Gomont) Anagnostidis – на раковине мидии; лит.; б. Биофильтров; ед. (собств.: Phormidium persicinum (Reinke) Gomont).
 
−
Род Spirulina Turpin ex Gomont
 
−
*Spirulina tenuissima Kützing– супр.; в щелях скал; ред. (Возжинская, 1967). Обрастания; сваи пирса ББС; ед.; трещины скал на литорали; Ч. Щельи, м. Киндо, б. Биофильтров; об. (собств.).
 
−
*Spirulina major Kützing – планкт.; В. Салма; ред. (собств.).
 
−
 
 
−
*[[Порядок Synechococcales]]
 
−
===Семейство Chamaesiphonасеае Borzi===
 
−
Род Chamaesiphon A. Braun & Grunow in Rabenhorst
 
−
*Chamaesiphon confervicola A. Braun – эпифит на Batrachospermum, вод., хвоинках; оз. Верх., Ерш.; ед. (собств.: Chamaesiphon confervicola и Chamaesiphon curvatus (Borzi) Nordstedt).
 
−
*Chamaesiphon incrustans Grunow – мор, лит., супр.; на камнях, зел. вод.; ед. (Давыдов, 2006).
 
−
*Chamaesiphon incrustans f. cylindricus (Boye-Petersen) Komárek & Anagnostidis – эпифит, на нитч.; пресн.; об.; на Zostera; ред. (собств.: Chamaesiphon cylindricus Boye-Peters).
 
−
 
 
−
===Семейство Merismopediaсеае Elenkin===
 
−
Род Aphanocapsa Nägeli
 
−
*Aphanocapsa grevillei (Hassall) Rabenhorst – планкт.; опресн. уч-ки В. Салма; ред.; в супр. ваннах; об.; в озёрах; масс. (собств.: Microcystis grevillei (Berkeley) Elenkin).
 
−
Род Coelosphaerium Nägeli
 
−
*Coelosphaerium kuetzingianum (Nägeli) Nägeli – супр., пресн., солоноват. ванны, оз.; планкт.; об. (собств.).
 
−
Род Eucapsis Clements & Shantz
 
−
*Eucapsis alpina Clem. & Shantz – пресн., бол., оз.; планкт.; ред. (Собств.).
 
−
Род Merismopedia Meyen
 
−
*Merismopedia elegans A.Braun ex Kützing – планкт.; мор.; ред; пресн., солон.; об. (собств.).
 
−
*Merismopedia minima G.Beck – планкт.; супр. ванны; ред. (собств.).
 
−
*Merismopedia punctata Meyen – мор., приустьевая зона р. Нильма; планкт.; домин. (Лихачёва, 2003). Обраст.; пресн., солон.; об. (собств.).
 
−
*Merismopedia tenuissima Lemmermann – пресн.; оз Верх.; планкт. (Бизина, 1998). Пресн., солон.; планкт.; об. (собств.).
 
−
*Merismopedia warmingiana Lagerheim – мор.; планкт.; ед. (собств.).
 
−
Род Synechocystis Sauvageau
 
−
*Synechocystis aquatillis Sauvageau – супр.; на камнях; ед. (Давыдов, 2006). Планкт., опресн. уч-ки мор., супр. ванны; о. (собств.)
 
−
*Synechocystis crassa Woronichin – планкт.; оз. Верхнее; об. (собств.).
 
−
*Synechocystis minuscula Woronichin – планктон; море; ед. (собств.).
 
−
 
 
−
===Семейство Synechococcaceae J. Komárek & K.T. Anagnostidis===
 
−
Род Sinechococcus Nägeli
 
−
*Synechococcus elongatus (Nägeli) Nägeli – обрастания; супр.; камни, скалы, брёвна об. (собств.).
 

Latest revision as of 23:44, 29 June 2011

rus:Eubacteria Species of prokaryotic organisms (except cyanobacteria) are given according to the system given in:

1) Bergey’s Manual of Systematic bacteriology // D. R. Boone, R. W. Castenholz (eds) v.1; Springer-Verlag. 2nd ed. 2001;

2) Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology // D. J. Brenner, N. R. Krieg, J.T. Staley (eds) v.2. part A; Springer-Verlag. 2nd ed. 2005.

В. М. Горленко, Г. А. Дубинина, Л. М. Захарчук, Н. Ю. Татаринова

Bacteria were extracted from soil samples of the Kindo Peninsula, the freshened areas of the Great Salma, and from algo-bacterial mats of supralittoral sea coast areas, exposed to freshening by continental runoff and to salinity at high tides.

Phylum Proteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005

Class Alfaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005

Class Betaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005

Class Gammaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn 2005

Phylum Chlorobi Garrity & Holt 2001

Class Chlorobia Garrity & Holt 2001

Phylum Chloroflexi Imhoff 2001

Class Chloroflexi Imhoff 2001

Phylum Firmicutes Garrity & Holt 2001

Class Bacilli Ludwig & Klenk 2001

Phylum Actinobacteria Brown et al. 2005

Class Actinobacteria Stackebrandt et al.1997

Phylum Bacteroidetes Garrity & Holt 2001

Class Flavobacteria Garrity & Holt 2001


CYANOBACTERIA (PROKARYOTIC ALGAE)

Authors: Е.А. Кузнецов, К.Л. Тарасов

Phylum Cyanophyta (Cyanobacteria), blue-green algae

Class Cyanophyceae